Ce terme a plusieurs sens suivant le contexte :
- Accord international entre plusieurs pays (ex. : protocole OSPAR = protocole de la convention d'Oslo et de Paris)
- Description précise d'une procédure, d'un mode opératoire à suivre (à respecter) dans des travaux de terrain (prélèvements) ou de laboratoire (analyses) ou tout autre activité de réalisation d'essais. La mise sous assurance qualité nécessite une formalisation rigoureuse des protocoles.(ν)